Rencana Induk memberikan estimasi kebutuhan dana  untuk pembangunan kembali Aceh dan Nias mencapai Rp 60 Triliun. Sesuai perkembangan di lapangan, kebutuhan dana diperkirakan meningkat menjadi Rp 74,8 Triliun.
 
Kebutuhan anggaran sebesar ini diantaranya dipenuhi dari APBN sebesar Rp 25,5 Triliun hingga akhir tahun 2007. Sisanya diharapkan dapat dipenuhi dari APBN 2008-2009, kontribusi masyarakat dan swasta, negara donor, LSM asing, badan kerja sama multilateral dan Badan PBB. Secara umum, sumber pendanaan rekonstruksi Aceh dan Nias berasal dari sumber-sumber berikut:

1. APBN

2. Non-APBN yang tediri dari bantuan negara dan institusi keuangan internasional, masyarakat dan swasta, LSM dalam dan luar negeri, bantuan bilateral, lembaga multilateral dan Badan PBB.

Sampai Juli 2007, BRR telah mencatat komitmen dana non APBN mencapai Rp 31,7 Triliun. BRR juga memobilisasi dana melalui Recovery Aceh Nias Trust Fund (RANTF), yang telah berhasil mengumpulkan dana  (managed fund) hingga Rp 140 Miliar. 

Dengan demikian, total komitmen yang diperoleh dari dana APBN dan Non-APBN sampai akhir 2007 mencapai Rp 57,2 triliun. Jumlah tersebut setara dengan 76 persen kebutuhan total dari rehabilitasi dan rekonstruksi.
.